Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F2P78329 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms