Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP1CAP62136 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms