Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO4P61968 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO4P61968 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO4P61968 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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