Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms