Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
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CLDN15P56746 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CLDN15P56746 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CLDN15P56746 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CLDN15P56746 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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CLDN15P56746 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN15P56746 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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