Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP6P55212 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CASP6P55212 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP6P55212 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP6P55212 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP6P55212 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP6P55212 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP6P55212 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CASP6P55212 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP6P55212 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CASP6P55212 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CASP6P55212 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP6P55212 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP6P55212 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms