Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms