Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD2P49005 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD2P49005 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD2P49005 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD2P49005 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLD2P49005 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLD2P49005 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLD2P49005 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLD2P49005 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD2P49005 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD2P49005 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD2P49005 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms