Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms