Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CDKN1BP46527 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms