Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRATP43155 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRATP43155 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRATP43155 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRATP43155 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRATP43155 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRATP43155 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRATP43155 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRATP43155 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRATP43155 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms