Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCCP43146 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCCP43146 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DCCP43146 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCCP43146 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCCP43146 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCCP43146 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCCP43146 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCCP43146 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCCP43146 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCCP43146 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCCP43146 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCCP43146 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCCP43146 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCCP43146 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCCP43146 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCCP43146 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms