Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP3P42574 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP3P42574 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP3P42574 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms