Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD13P35453 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms