Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GPC1P35052 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GPC1P35052 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GPC1P35052 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC1P35052 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms