Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms