Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CD40LGP29965 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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