Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP1P29466 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP1P29466 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms