Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHC1P29353 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms