Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms