Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms