Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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