Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC175P0C221 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms