Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRPRAP08240 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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