Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SFTPBP07988 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SFTPBP07988 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SFTPBP07988 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SFTPBP07988 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SFTPBP07988 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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