Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK1P06493 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms