Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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