Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNJ1O43426 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SYNJ1O43426 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SYNJ1O43426 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNJ1O43426 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNJ1O43426 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ1O43426 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ1O43426 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ1O43426 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ1O43426 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ1O43426 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ1O43426 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ1O43426 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ1O43426 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ1O43426 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ1O43426 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ1O43426 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNJ1O43426 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms