Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCAO15360 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCAO15360 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCAO15360 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCAO15360 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms