Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNMO15061 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNMO15061 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNMO15061 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNMO15061 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNMO15061 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNMO15061 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNMO15061 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNMO15061 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNMO15061 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNMO15061 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms