Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms