Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms