Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP17L12C9JPN9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms