Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRT4C9JH25 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRT4C9JH25 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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