Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms