Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVV-1B6SEH8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms