Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFAP73A6NFT4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CFAP73A6NFT4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms