Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FRMD3A2A2Y4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FRMD3A2A2Y4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms