Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms