Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms