Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNPO3Q9Y5L0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms