Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PKP3Q9Y446 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKP3Q9Y446 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKP3Q9Y446 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKP3Q9Y446 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKP3Q9Y446 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKP3Q9Y446 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKP3Q9Y446 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKP3Q9Y446 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKP3Q9Y446 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKP3Q9Y446 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKP3Q9Y446 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKP3Q9Y446 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PKP3Q9Y446 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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