Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMPQ9Y244 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms