Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHANK2Q9UPX8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms