Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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USP18Q9UMW8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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