Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms