Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms