Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms