Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms