Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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